南京市公共卫生医疗中心位于江宁区青龙山，其污水站污水主要来源于医院的诊疗室、化验室、病房、洗衣房和手术室等排放的医疗废水及区域内生活污水。污水站设计处理规模为1000m³/d，采用A/A/O+MBR工艺；预消毒采用臭氧消毒；后消毒采用二氧化氯消毒；臭气处理工艺采用活性离子+生物土壤滤池除臭；设置离心脱水机，脱水后污泥作为危险固体废弃物处置。

污水处理站出水水质执行《城镇污水处理厂污染物排放标准》（GB18918-2002）一级A排放标准。